أولاً: قسم تقنية المعلومات:
يشرف القسم على صيانة النظم الآلية المستخدمة ومحطات العمل في المكتبات ومتابعتها يومياً ويقدم الحلول والمقترحات للمشاكل التي تواجه مستخدمي النظم من موظفي المكتبات وروادها، ويقوم بالتنسيق الفني بين شركات النظم الآلية والجهات الأخرى المعنية بذلك في الجامعة مثل إدارة الاتصالات وتقنية المعلومات لتحديد أنسب المواصفات لاختيار الأجهزة والمعدات وإجراء التحديثات اللازمة للأنظمة وصيانتها.
ويشرف القسم على إدارة وتشغيل النظام الآلي لإدارة المكتبات (سييرا-Sierra) وإدارة واجهة ويب المستخدم النهائي للفهرس الآلي (Sierra Web-OPAC) للمكتبة الذي يتيح البحث في فهرس المكتبة من خلال متصفح ويب قياسي، وكذلك الإشراف على البوابة الإلكترونية لعمادة شؤون المكتبات التي توفر خدمة الوصول الى المكتبة الرقمية السعودية وللمخزن الرقمي لجامعة بيشة.
كما يشرف القسم على تنظيم وإقامة الدورات التدريبية للتدريب على استخدام نظام (سييرا-Sierra) للموظفين وطريقة البحث في الفهرس الآلي للمستفيدين، والدورات التدريبية للتعريف بالمكتبة الرقمية السعودية وكيفية استخدامها والوصول لمصادرها عن طريق البوابة الإلكترونية لعمادة شؤون المكتبات.
ثانياً: قسم خدمات المستفيدين:
يقدم قسم خدمات المستفيدين العديد من الخدمات المباشرة لجمهور وزوار المكتبات التابعة لعمادة شؤون المكتبات، مثل خدمات الإعارة وخدمات الإرشاد والتوجيه والمساعدة على البحث.
وتعتبر خدمة الإعارة أهم الخدمات المقدمة في المكتبات لجمهور المستفيدين، بحيث تتيح لجميع منسوبي جامعة بيشة الاستفادة من الكتب واستعارتها خارج المكتبة وفق ضوابط وسياسات الإعارة المعتمدة، ويمكن لغير منسوبي جامعة بيشة ان يقوموا بتسجيل العضوية في المكتبة والاستفادة من خدمات الإعارة وغيرها من الخدمات.
ويشرف هذا القسم على إرشاد وخدمه الطلاب وأعضاء هيئه التدريس على طرق البحث في الفهرس الآلي الخاص بنظام إدارة المكتبات والتعريف بخصائصه ومزاياه، ومساعدة الطلاب في بحثهم عن المراجع والكتب واستخراجها لهم من الأرفف، والرد على الأسئلة والاستفسارات الواردة إلى عماده شؤون المكتبات عن طريق عناوين التواصل الخاصة بعمادة شؤون المكتبات.
ثالثاً: قسم الاجراءات الفنية:
ويعتبر هذا القسم من أكثر الأقسام أهمية وحيوية في العمادة؛ لأنه يقوم بالعملية الأهم وهي توفير المصادر والمراجع للمستفيدين، والتي تنبني عليها بعد ذلك جميع الخدمات التي تقدمها المكتبات.
-وحدة التزويد:
تشرف هذه الوحدة على تنفيذ سياسات التزويد المتبعة في العمادة والقيام بعمليات الاختيار لقوائم الكتب وتلبية احتياجات الكليات المختلفة ومراعاة المناهج الدراسية وحاجات الباحثين، ويتم ذلك من خلال الكثير من عمليات الاتصال بين الناشرين وبين الجهات المختصة في الكليات لمتابعة تحديث القوائم ومعرفة الجديد في السوق وعرضه على أعضاء هيئه التدريس للاختيار من بينها بما يناسب احتياج البرامج، ومن ثم تجهيز القوائم النهائية للطلب والشراء.
-وحدة الفهرسة والتصنيف
وتعتبر هذه الوحدة عصب المكتبات إذ تتولى استلام الكتب بعد طلبها والقيام بعمليات الفرز والتجهيز والتصنيف والترفيف، وتتم عمليات إدخال بيانات الوصف الببليوغرافي للكتب (الفهرسة الآلية) في نظام إدارة المكتبات (سييرا-Sierra) ليسهل على المستفيدين البحث عن الكتب، وتشمل العمليات الفنية القيام بطباعة الباركود ووضع وسيمات الحماية من السرقة على الكتب وتجهيز كعب الكتاب بتصنيف الكتاب ومن ثم القيام بترفيع الكتب في اماكنها الصحيحة ليسهل الوصول إليها من خلال نظام تصنيف ديوي العشري العالمي الذي تتبعه مكتبات جامعه بيشة.
رابعاً: قسم الاهداء والتبادل:
يشرف هذا القسم على تنظيم عمليات الإهداء والتبادل بين العمادة والجهات الخارجية، وعادة ما يكون تبادل مجموعات بين مكتبات الجامعات السعودية وبين بعض الجهات الحكومية من خلال آلية واضحة ومقننة للتبادل تتم بين الجهات.
ويشرف القسم على استقبال الهدايا الواردة للجامعة من الجامعات والهيئات ومراكز البحوث داخل المملكة وخارجها ومن الهيئات الحكومية ومن بعض دور الطباعة والنشر وكذلك الاهداءات الشخصية من المؤلفين أو المكتبات الخاصة ببعض الاشخاص.
خامساً: قسم العلاقات العامة:
يعتبر هذا القسم هو الواجهة لعمادة شؤون المكتبات وحلقه الوصل بينها وبين كافة قطاعات الجامعة والمجتمع، يقوم هذا القسم بالتعريف عن المكتبة وخدماتها التي تقدمها من خلال المشاركات في المؤتمرات والمعارض كما يشرف على تنظيم زيارات الوفود للعمادة وإعداد وتنظيم الفعاليات وورش العمل والمعارض الداخلية، كذلك يشرف على عملية تنسيق حجز الخلوات والقاعات الدراسية للباحثين والفرق البحثية.
سادساً: قسم المجموعات الخاصة:
وحدة الرسائل العلمية: الإشراف على تنسيق رسائل الماجستير والدكتوراه الصادرة من جامعة بيشة أو من خارجها.
وحدة المكتبات الخاصة: الإشراف على تنسيق المكتبات الشخصية التي اهديت من قبل أصحابها إلى العمادة.